Neuropsykologinen kuntoutus on usein osa aivovammasta tai aivovauriosta toipuvan henkilön tai lapsilla kehityksellisestä oppimisvaikeuksista johtuvien ongelmien lääkinnällistä kuntoutusta. Heikentyneitä toimintoja vahvistamalla, niitä korvaavia toimintatapoja opettelemalla sekä jäsentämällä ja koostamalla säilyneitä toimintoja voidaan usein lieventää syntynyttä neuropsykologista oirekuvaa.
Oppimisen erityisvaikeuksista kärsivien nuorten ja aikuisten neuropsykologisella kuntoutuksella pyritään vahvistamaan tarpeen mukaan luki- ja matemaattisia taitoja, visuaalista toimintakykyä, oman toiminnan ohjaamistaitoja sekä keskittymisen ja tarkkaavaisuuden osatekijöiden hallintaa. Näiden osa-alueiden kuntouttaminen luo perusteita oppimisvalmiuksien parantamiselle ja kehittämiselle.
Neuropsykologin asiakkaita ovat mm. aktiivisuuden ja tarkkaavuuden häiriöistä (ADHD), aivovammojen jälkitiloista, oppimisen erityisvaikeuksista ja muista neurologisperäisistä ongelmista kärsivät henkilöt. Näihin voi liittyä myös psyykkisen toimintakyvyn heikkenemistä, jonka taustalla voivat tällöin olla esimerkiksi mielialatekijät tai omaan tilanteeseen liittyvä ahdistuneisuus.
Kuntoutustyössä käytetään neuropsykoterapeuttista viitekehystä mikä tarkoittaa neurotieteellisen ja psykoterapeuttisen näkökulman yhdistämistä sekä tutkimus- että kuntoutusprosessissa. Keskeistä on asiakkaan ongelmien ja elämäntilanteen tarkastelu suhteessa arjen hallintaan ja toimintakyvyn käytännön rajoituksiin.